在博物馆领导的支持下，《孔庙国子监论丛》已成功出版了六期。《孔庙国子监论丛》为馆内业务人员展示科研成果，为专家学者交流科研动态提供了一个平台。2011年共向馆内职工及知名学者征集27篇论文，共计22万字。2012年馆刊工作已启动，现向博物馆全体职工发出征稿通知。